La struttura organizzativa della FUCI è di tipo federativo, ogni livello elegge i rappresentanti al livello superiore, e per ogni livello esistono due cariche una femminile e una maschile:
1) Gli aderenti di ogni gruppo eleggono i presidenti di gruppo
2) I Presidenti di Gruppo di una stessa regione eleggono gli Incaricati Regionali nelle Assemblee Regionali
3) Gli Incaricati Regionali e i Presidenti di Gruppo, più la Presidenza Nazionale e i consiglieri uscenti formano l’Assemblea Federale.
Approvano le mozioni di indirizzo ed eleggono i nuovi sei Consiglieri Centrali.
4) Gli Incaricati Regionali più i Consiglieri Centrali più i membri uscenti della Presidenza Nazionale, eleggono i nuovi membri della Presidenza Nazionale nel Consiglio Centrale
Esistono quindi tre livelli diversi con i rispettivi incarichi:
• GRUPPO:
Aderenti, Presidenti di gruppo
• REGIONALE:
Presidenti di gruppo, Incaricati Regionali
• NAZIONALE:
Incaricati Regionali, Consiglieri Centrali , Presidenza Nazionale
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